目录
①六种癌症类型共有的CAF亚型（pan-CAFs）
1，六种泛CAF亚型的鉴定和分子表征
2，Pan-CAF亚型特异性转录因子和基因调控网络
3，预后分析
4，Pan-CAF亚型与肿瘤中特定分子功能的关联
②泛癌单细胞转录图谱上癌症相关成纤维细胞的分子分类
1， 泛癌 CAF 图谱的构建和分析
2，四种 CAF 亚型中不同生物标志物的鉴定和表征
3，CAF亚型转录因子之间的激活多样性
4，CAF亚型在肿瘤进展中的进化途径
5，细胞环境中不同CAF亚型之间的互通网络
6， CAF 亚型作为预后指标的临床意义
7，靶向matCAF的药物筛选和验证
8，讨论部分
肿瘤相关成纤维细胞综述学习_肿瘤相关成纤维细胞系-CSDN博客
①六种癌症类型共有的CAF亚型（pan-CAFs）
Molecular Features of Cancer-associated Fibroblast Subtypes and their Implication on Cancer Pathogenesis, Prognosis, and Immunotherapy Resistance - PubMed (nih.gov)
我们对黑色素瘤 （MEL）、头颈部鳞状细胞癌 （HNSC） 和肺癌 （LC） 的 CAF 进行了综合分析，并确定了每种 CAF 亚型中明显活跃的分子特征。鉴定了单个 CAF 亚型的基因特征，并用于研究亚型丰度与临床结果和免疫治疗耐药性的关联。我们确定了六种癌症类型共有的CAF亚型（pan-CAFs），并揭示了区分它们的分子特征和遗传途径。有趣的是，这些 CAF 亚型表达不同的免疫抑制因子，例如 CXCL12 和 CXLC14，以及干细胞促进因子 IL-6。此外，我们还鉴定了对 CAF 异质性至关重要的新型转录驱动因子（MEF2C、TWIST1、NR1H3、RELB 和 FOXM1）。此外，我们发现CAF亚型与不同的临床结果相关，并揭示了可以激活或抑制癌症进展或参与抗PD1或抗PD-L1免疫治疗耐药性的关键分子途径。
1，六种泛CAF亚型的鉴定和分子表征
pan-CAF亚型的标记基因和生物学过程。
（A） UMAP（左）描绘了亚型，热图（右）描绘了与 pan-CAF 亚型相关的标记基因。Pan-myCAF，肌成纤维细胞样CAF;pan-dCAF，结缔组织增生性CAF;pan-iCAF 和 pan-iCAF-2，炎性样 CAF;pan-nCAF，正常肌成纤维细胞;pan-pCAF，增殖 CAF。（B） 单个癌症类型中 CAF 亚型的比例。（C）显示pan-CAF亚型标记基因表达的点图。（D） 泛CAF亚型的富集基因集。（E） 描述泛CAF亚型细胞周期状态的UMAP。（F） 与选定功能相关的基因表达热图。（G）编码细胞表面蛋白的基因表达热图。
2，Pan-CAF亚型特异性转录因子和基因调控网络
（A）转录因子基因表达的热图。（B） 描绘 MEF2C 表达的小提琴图（上图）和描绘 MEF2C 靶基因在 pan-myCAF 中上调的热图。（C） 描绘 TWIST1 表达的小提琴图（上）和描绘 TWIST1 靶基因在 pan-dCAF 中上调的热图。（D） 描绘 NR1H3 表达的小提琴图（上）和描绘 NR1H3 靶基因在 pan-iCAF 中上调的热图。（E） 描绘 RELB 表达的小提琴图（上图）和描绘 pan-iCAF-2 中上调的 RELB 靶基因的热图。（F） 描绘 FOXM1 表达的小提琴图（上）和描绘 FOXM1 靶基因在 pan-pCAF 中上调的热图。
3，预后分析
4，Pan-CAF亚型与肿瘤中特定分子功能的关联
节点是肿瘤中表达较高的基因中富集（红色圆圈）或耗尽（蓝色圆圈）的项，泛CAF基因特征表达增加，而边缘则将术语与重叠基因连接起来。使用 Enrichmentmap 通过更通用的术语进一步总结了具有类似功能的连接节点。在每个节点中，填充的颜色代表来自各个癌症类型的结果。（A） 由 BLCA 和 KIRP 癌症引起的 pan-myCAF。（B） KIRC、KIRP、LGG、UVM、MESO 和 STAD 癌症的 pan-dCAF 结果。（C） LGG 的泛 iCAF 结果。（D） LGG 和 SKCM 癌症的 pan-iCAF 2 结果。（E） KIRC、KIRP、LGG 和 MESO 的 pan-pCAF。
②泛癌单细胞转录图谱上癌症相关成纤维细胞的分子分类
The molecular classification of cancer-associated fibroblasts on a pan-cancer single-cell transcriptional atlas - PubMed (nih.gov